А.А. Шарапов является автором монографии «Государства Азиатско-Тихоокеанского региона в системе международных отношений Республики Узбекистан» (2014г, на узбекском языке), является соавтором монографии «Политика Китайской Народной Республики в сфере образования» (2012г, на русском языке) и опубликованы научные статьи о современных международных отношениях в Азиатско-Тихоокеанском регионе, КНР, Японии, Южной Кореи, ЦА и др. Он регулярно читает курсы по конфликтологии, международным отношениям и геополитике в АТР и Центральной Азии.